휘들러 다운로드

Widdler는 모든 기능이 작동하려면 파이썬 2.7 및 Java-1.8을 사용자 환경에서 로드해야 합니다. Widdler는 이제 Google 클라우드 VM에서 실행되는 Cromwell 서버에서 데이터 처리 및 클라우드 스토리지 버킷에 저장되는 워크플로우 실행을 지원합니다. 클라우드 서버를 사용하려면 사용자는 먼저 GCP를 사용하여 수동으로 인증해야 합니다(이미 Google 클라우드 플랫폼 계정을 만들었다고 가정합니다): 마지막으로 다시 시작된 워크플로는 원래 워크플로의 레이블을 상속합니다. @dirtydurk: 🙂 그래서 다재다능한, 그 사람. 들어 주셔서 감사합니다! 큰 업! Widdler는 크롬웰 서버에서 WDL 워크플로를 실행하기 위한 명령줄 도구입니다. 기능 포함: 아무 일도 발생 하지 않으면 GitHub 데스크톱을 다운로드 하 고 다시 시도 합니다. 젠장 아들. 전화하지 마십시오 f ** 왕 아름다운입니다! 망고시 참고 이 경우 워크플로에서 실패한 단계에 대한 stdout 또는 stderr가 없었습니다. 이렇게 하면 하위 워크플로우를 사용하는 워크플로가 실행됩니다: (Java-1.8 필요, 유효성 검사를 시도하기 전에 `Java-1.8 사용`) 예를 들어 widdler.py 2f8bb5c6-8254-4d38-b010-620913d325e 쿼리 -s-S 에일 . Widdler는 widdler.log라는 파일에서 응용 프로그램의 로그 디렉토리에 정보를 기록합니다. 이 기능은 워크플로 ID 및 쿼리 결과를 비롯한 widdler 실행에 대한 정보를 찾는 데 유용할 수 있으며 사용자가 워크플로 ID를 잃어버린 경우 워크플로 ID를 찾는 데 도움이 될 수 있습니다. 로그의 각 실행은 사용자의 사용자 이름이 편리한 식별을 위해 시작/중지 구분 기호에 표시된 것처럼 표시됩니다.

다음은 widdler의 실행 도움말 텍스트입니다. 사용자가 wdl 파일, json 파일을 제공하고 실행에 사용할 수 있는 서버 중 하나를 나타낼 것으로 예상합니다. 유효성 검사 옵션은 제출된 WDL 및 JSON 파일의 유효성을 검사하며 기본적으로 사용 중입니다. . . Widdler를 사용하면 워크플로를 모니터링할 수 있습니다. 쿼리 옵션과 달리 모니터링은 워크플로가 터미널 상태에 도달할 때까지 유지됩니다(`실행 중` 또는 `제출됨` 이외의 모든 상태). 모니터링하는 동안 선택적으로 워크플로상태를 화면에 인쇄할 수 있으며, 터미널 상태에 도달하면 워크플로가 완료되면 선택적으로 사용자에게 전자 메일(사용자가 broadinstitute.org 도메인으로 가정됨)을 전자 메일로 보낼 수 있습니다. 다음은 widdler의 기본 도움말 텍스트입니다. Widdler는 실행, 쿼리 또는 중단이라는 세 가지 사용 모드 중 하나가 첫 번째 인수로 표시될 것으로 예상합니다.

브로드 인스티튜트/위들러에서 새로운 릴리스에 대한 알림을 원하십니까? json 파일에 오류가 있는 경우 런타임 유효성 검사보고서와 동일한 방식으로 오류 목록이 보고됩니다. 예: 이 것을 사랑합니다. 쿠르사 그냥 좋은 홈을 만들기에 집착오버하려고하지 않습니다. 잘 성취! 닌텐지 . widdler의 실행 명령을 사용하여 단일 워크플로를 모니터링하는 것 외에도 다음 예제와 같이 모니터를 실행할 수도 있습니다. 이 작업을 수행하는 방법은 다음과 같습니다: 종속성이 있는 WDL 파일 유효성 검사의 유효성 검사에 대한 참고 사항: 현재 depedency 유효성 검사 구현의 제한으로 인해 WDL 파일 종속성은 기본 WDL 파일과 동일한 디렉터리에 있어야 하며 압축을 해제해야 합니다.